Под nix-системами достаточно dd, а вот под винду несколько иначе:

A. утиль для снятия и наливки образов CF-карт
Нажмите для просмотра прикрепленного файла
это удобная программка для работы с образами CF-карт в сыром виде
очень удобна для тиражирования образов


B. Мой утиль для работы с партициями - v1.00 написано за вечер
Нажмите для просмотра прикрепленного файла

краткая инструкция по моей программе
1. загружаем или создаем образ в памяти
2. можно записать отдельные партиции в файлы
3. можно загрузить образа в партиции
4. запись итогового образа для заливки на CF

если нужен какой-то еще функционал - пишите
оригинальный образ